自从奥特曼的初代与早田进的邂逅，怪兽频繁出没，保卫地球的任务已然历经漫长岁月。每一次与怪兽的交锋，都如同鬼门关前走一遭，靠着与人类的羁绊屡屡化险为夷。但此次，奥特曼面临了前所未有的挑战，宇宙中的霸主——宇宙恐龙杰顿，正对其构成巨大威胁。让我们共同见证，初代奥特曼在地球上的终极一战。
地球危机重重，外部天空中惊现大量宇宙飞船，直逼地球而来。科特队的村松队长果断下令出击。富士队员留守本部，然而危机早已悄然降临。杰顿星人伪装成岩本博士的模样，潜入控制室，富士队员后总部通讯设备便逃之夭夭。
科特队队员消灭飞船残余之际，尝试联系总部时却发现富士队员失去回应。他们意识到事态严重，迅速返回总部，看到倒在地上的富士队员虽无大碍，但情况仍十分危急。早田进、岚队员以及村松队长立即追踪岩本博士的踪迹。岚队员扑倒博士的瞬间，博士现出原形，原来他早已被杰顿星人操控。
早田进见状立即发起攻击，杰顿星人在消失之际，不断喊着“杰顿”。科特队初时不明其意，后来才了解，这是杰顿星人在唤醒宇宙中的霸主——宇宙恐龙杰顿。
杰顿出现后径直前往科特队总部大楼，楼内仍有多名队员和岩本博士。早田进赶至楼下，拿出贝塔魔棒变身。初代奥特曼现身后，尝试以捕捉光换限制杰顿的行动，但杰顿轻易化解。随后它如鬼魅般消失在原地，令奥特曼措手不及。杰顿突然现身其背后发起攻击，奥特曼虽灵活躲避，但攻击仍命中科特队大楼，留下数个洞孔。
奥特曼并未退缩，发射八分光轮进行反击，但杰顿启动屏障阻挡。此时科特队大楼内的队员已安全撤离。富士队员目睹此景，为奥特曼鼓劲打气。奥特曼变换招式以拳脚攻击，但杰顿力量强大，轻松奥特曼并迫使其陷入苦战。彩色计时器开始闪烁警告。奥特曼拼尽全力挣脱束缚并重新站起，发射斯派修姆光线反击。然而杰顿不仅吸收攻击还反弹回来击中奥特曼的彩色计时器。奥特曼行动逐渐迟缓直至彩色计时器完全熄灭倒下。在这绝境之中伊初队员携新武器登场一击将杰顿摧毁。
此刻经典一幕上演，光之国的佐菲奥特曼降临凡间带来生命能量复活了早田进和初代奥特曼并将他们带回光之国中继续守护这片宇宙的和平与正义。